Ve druhém ročníku se Hermiona zamilovala do nového učitele obrany proti černé magii Zlatoslava Lockharta, kterého později také využije k tomu, aby se dostala v knihovně do oddělení s omezeným přístupeme ke knize Lektváry nejmocnější, s jejíž pomocí se jí pak podaří excelovat při výrobě mnoholičného lektvaru, který Harry a Ron použijí k tomu, aby jako Crabbe a Goyle vyslechli Draca ohledně toho, kdo je Zmijozelův dědic. Hermiona si omylem místo vlasu Millicent Bullstrodeové vezme chlup její kočky a protože se lektvar nemá používat na zvířata, musí na ošetřovnu. V tomto díle Hermiona také ukáže, že není jen šprtkou, ale že dokáže i porušit školní řád, když potřeby k lektvaru ukradne ze Snepeova kabinetu. Později Hermiona zjistí, že netvor v tajemné komnatě je bazilišek, ale ten ji napadne právě, když to chce oznámit ostatním. Hermiona ale použila zrcátko, a tak nezemřela, ale pouze zkameněla. Nešla tak spolu s Harrym a Ronem do tajemné komnaty.



